Shaddam IV., imperátor milionu světů, se obává, že ztratí trůn Zlatého lva, a tak přichází s odvážným plánem na vývoj alternativní melanže, návykového koření, jež drží celé Impérium pohromadě a lze ho najít jen na pouštním světě Duna.

V podzemních laboratořích na planetě strojů Iksu využívají krutí tleilaxanští Páni otroky a vězně, aby vynalezli syntetickou formu melanže. Pokud se jim to podaří, Shaddam tak získá neomezenou moc, po níž touží.

Vévoda Leto Atreides, zdrcený žalem z tragické smrti svého syna Victora, je odhodlaný znovu obnovit čest svého rodu a má s Iksem vlastní plány. Osvobodí Iksany od tyranských dobyvatelů a pomůže svému příteli princi Rhomburovi, zraněnému synovi diskreditovaného rodu Verniů, zaujmout jeho právoplatné místo vládce strojové planety. Jedná se o odvážný a riskantní krok, jelikož rod Atreidů má omezené vojenské zdroje a mnoho nemilosrdných nepřátel, včetně sadistického barona Harkonnena, despotického vládce Duny.

Mezitím krásná lady Jessica, konkubína vévody Leta, počne na příkaz Sesterstva dítě, jež má být předposledním krokem ve vytvoření všemocné bytosti. Bene Gesserit však netuší, že dítě, jež Jessica čeká, není dívka, ale chlapec. Jessičina neposlušnost je aktem lásky – chce totiž svému vévodovi poskytnout mužského dědice –, ovšem může mít nedozírné následky jak pro matku, tak pro dítě.

Stejně jako Bene Gesserit, i Shaddam Corrino plánuje, jak zajistit svůj odkaz. Imperátor, zaslepený touhou po moci, zosnuje spiknutí proti Duně, jedinému přirozenému zdroji koření. Pokud uspěje, jeho šílenství vyústí v tragédii, jejíž následky nedokáže předvídat: v zánik meziplanetárního cestování, Impéria i samotné civilizace.

S vévodou Letem a dalšími revolucionáři, kteří se snaží zastavit příval temnoty hrozící pohltit celý vesmír, je vše připraveno na rozhodující boj o budoucnost lidstva.